I principali percorsi presenti nel Parco si snodano in due aree geografiche precise.
La prima è quella della valle fluviale del Torrente Lanza, che attraversa il parco in direzione nord-est/sud-ovest, i cui percorsi (sentieri sterrati, strade campestri e pista ciclopedonale) seguono la direttrice Santa Margherita (Bizzarone) – stazione di Valmorea – Mulini di Cagno – Folla di Malnate – Mulini di Gurone, costeggiando quasi sempre il corso del torrente e la linea ferroviaria storica.
La seconda area dove si sviluppano i percorsi è quella che dai Monti Casnione e Morone (tra Malnate e Cagno) scende ad abbracciare la piana boscata e coltivata che si estende tra Cagno e Albiolo.
Ad ora sono stati identificati sette differenti percorsi